Το εστιατόριο ονομάζεται από την ελληνική φράση "μολαράκι", που σημαίνει "πολύ μικρό λιμάνι", επειδή βρίσκεται στην περιοχή Τούρλος της Μυκόνου, όπου παλαιότερα υπήρχε ένα μικρό λιμάνι για αλιευτικά σκάφη.Σήμερα, στην ίδια περιοχή βρίσκεται το εξελιγμένο Νέο Λιμάνι και η Μαρίνα της Μυκόνου, όπου ελλιμενίζονται κρουαζιερόπλοια, μηχανοκίνητα σκάφη και ιστιοπλοϊκά σκάφη κατά τη διάρκεια της παραμονής τους στο νησί.

Η Molaraki ιδρύθηκε το 2009 ως η λογική εξέλιξη μιας παραδοσιακής μυκονιάτικης επιχείρησης με τέσσερις δεκαετίες επιτυχίας στον τομέα του τουρισμού.